CRISPRclean RNA Depletion Panel (Liver)
使用我们专注于肝脏组织的RNA去除面板,精确定位低表达的转录本
我们的CRISPRclean组织特异性RNA去除面板可在测序之前体外去除高表达的转录本,将约50%的测序聚类重新分配给唯一的与生物学相关的转录本,从而使您最大限度地利用UMI(唯一分子标识符)和基因灵敏度。
最大限度地增加肝脏组织的测序覆盖率
RNA样本通常具有少量高度表达、经过充分表征的转录本,这些转录本与低表达的转录本竞争测序覆盖率。重新测序这些转录本添加的生物学相关信息很少。测序覆盖的缺乏,加上高表达转录本的显著噪声,限制了对低表达基因、罕见变异和可能是疾病驱动因素的独特融合事件的检测。
CRISPRclean利用Cas9去除和一组引物,根据GTEx portal的查询结果设计,从组织中去除约50%的最高表达转录本。这些引物组的设计旨在通过去除最少数量的编码基因转录本来最大限度地重新分配测序读数,从而保留相关的和新颖的生物学转录本。这些面板适用于已经进行核糖体去除或poly-A选择处理的RNA-Seq文库。
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