CRISPRclean Single Cell RNA Boost Kit
使用CRISPRclean提高可用的单细胞RNA序列数据
2x
转录组读长
1.5x
每个细胞检测到的基因增加*
50%
测序读长减少*
3
简单步骤
*来自PBMC的数据,不同细胞类型会有差异
传统上,单细胞数据处理包括细胞聚类和下游解释之前的某些过滤和标准化步骤。CRISPRclean不是在计算机中删除这些读长,而是在测序之前在体外删除这些读长。它将50%的测序簇重新分配到独特的生物相关转录本,使您能够最大限度地提高UMI和基因敏感性。
CRISPRclean利用Cas9去除和专门设计的guide set来删除在二次分析之前过滤的读长。CRISPRclean Single Cell RNA Boost Kit使您能够在对工作流程影响最小的情况下消除噪音,并对单细胞RNA序列结果产生更大的信心。
优势
与未去除的样品相比,去除的PBMC样品的每个细胞的基因和UMI检测灵敏度提高。
在用CRISPRclean处理的PBMC样品中鉴定出一种额外的细胞类型。
使用PBMC样品对有和没有去除的细胞簇的UMAP图显示,去除不会干扰细胞类型调用。
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