点击化学
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为了彻底理解生物分子的功能,关键的证据来自该分子的位置、空间和时间分布,以及与其他生物分子的交互知识。然而,解决这些问题很困难,因为所关注的分子通常都很复杂,而且大多数情况下浓度极低。为了理解分子的流动,还需要在活细胞或生物体中追踪这些分子。在活体环境中标记生物分子的常用方法是有限的:
- 通过化学修饰进行标记主要依赖于氨基或硫醇这类普遍存在的基团,导致标记群体异质性。
- 通过添加可遗传引入的标签(如GFP)进行标记可能会影响被标记蛋白的功能,因为标签的体积很大,且这种方法仅限于蛋白质分析。其他如核酸、糖或脂质这类分子很难被定位。
这些缺点通过"生物正交标记"的进展得到了克服。尽管基本原理起源于合成化学的考虑,但生命科学家最近发现了对生物分子进行最小影响标记的可能性。
最主要的优点是:
- 使用小分子引入标签(对功能的影响最小)
- 反应动力学极快,
- 简单的反应条件在水溶液中产生稳定且无毒的产品,
- 以及结合多种完全“非生物学”的标签的可能性,允许同时研究多种生物分子。
为了这一进步的基础是Sharpless努力模仿自然用简单的构建块和一个碳-异原子连接生产大的、复杂的生物分子的方法。对于这种带有便利性质的简单构建块的工具箱,Sharpless在2001年建立了"点击化学"这个术语,描述了一套快速和热力学有利的反应,实现了两个分子的高效和选择性连接。
更具体地说,点击反应是一个酰胺和炔烃之间的环加成反应。原来,铜催化的酰胺炔烃环加成(CuAAC)是经典的Huisgen环加成的改进。在两种情况下,一个末端炔烃与一个酰胺反应形成一个1,2,3-三唑。与原始的Huisgen反应相比,后者非常缓慢、不选择性且只能在较高温度下进行,铜催化的版本速度快几倍,在室温下高效运行,并选择性地给出三唑的1,4-区域异构体。
酰胺和炔烃官能团都可以轻松可靠地连接到寡核苷酸。
铜催化的环加成反应(Copper-catalysed cycloaddition reaction,CuAAC)
催化剂铜是细胞毒性的,因此这种方法主要在体外使用。另一方面,酰胺或炔烃的反应基团非常小,自然界中并不存在,这使得这种反应对许多方法来说都非常有趣。进一步的进展是通过Bertozzi等人的工作达到的,他们避免使用铜催化剂,而是使用应变的环辛烯环与酰胺反应。环内的"弹簧负载"足以允许快速反应,从而在活细胞中无毒地使用。
应变促进的酰胺-炔烃环加成反应(Strain-Promoted Azide-Alkyne Cycloaddition,SPAAC)
这种方法在几篇有趣的出版物中被使用,它们分别采用不同的技术标记蛋白质。在纳米生物技术领域,研究者对这些策略越来越感兴趣,这些策略允许应用不同的功能基团。四氮唑连接或TCO(tetrazine cyclooctene)点击反应描述了另一种生物正交反应方法。通过环加成反应,s-四氮唑和反-环辛烯转化为具有极快反应性的环状炔烃。在这个反应中,四氮唑是反应性的、电子丰富的基团,可以是开链的或环状的。通过排除二氮N2,四氮唑和环辛烯的替代基团链接到炔烃。
四氮唑连接(Tetrazine ligation)
四氮唑的另一个有趣特性是它能够猝灭几种染料的荧光,这种特性在与诺博烯或环辛烯进行四氮唑连接时被消除。这允许直接且敏感地追踪连接事件。四氮唑和环辛烯在生理条件下都是稳定的,由于它们相对较小的大小,这两种修饰不太可能显著地干扰生物分子的功能。该反应在非常低的浓度下发生且反应速度极快,这使得四氮唑连接也成为体内成像的一个有趣选择。
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