CRISPRclean Plus Stranded Total RNA Prep with rRNA Depletion
(Human, Mouse, Rat, Pan Bacteria)
使用CRISPRclean Plus识别低表达转录本
200+
核糖体RNA去除的细菌种类
3-7X
NSP样品中微生物覆盖率的增加
1
天工作流程
复杂的样本可能有细菌和人类细胞的混合物，它们都在积极表达核糖体RNA。利用CRISPRclean的强大功能，可以有效去除核糖体RNA。CRISPRclean还可以在测序之前在体外去除无信息的细菌读长——重新分配>80%的测序读数，以识别低表达的生物相关转录本。
优势
简化的CRISPRclean工作流程：用核糖去除制备单链总RNA文库
非常适合分析含有真核生物和细菌rRNA复杂混合物的样品
鼻咽（NSP）样本中SARS-CoV-2和其他基因组的覆盖率增加3至7倍
检测病毒基因组数据、微生物组组成、共感染和宿主基因表达的单一工作流程
CRISPClean Plus工作流程
>临床NSP样本中真核生物和细菌rRNA的80%去除
去除前后的比较表明，使用临床NSP样本，真核生物和细菌的rRNA有效去除率>80%，Ct值从阴性到38.93，病毒载量非常低。
去除后微生物的测序读长增加
去除样本S8中前十大高丰度生物（Ct值26.94）。
与未去除样本相比，高丰度生物平均每百万份增加10倍。
人类基因表达中更多的基因计数
去除前后的基因表达信号与线性R2高度相关，为0.8589。R2接近1.0表明，人基因表达在未去除和去除样品S7之间是保守的。注意，与未去除样品相比，去除样品的基因计数更多。
提高人类基因检测灵敏度
与未去除的样本相比，去除后检测到更多的基因。读取计数截止值80被用作1的CPM。
高细菌检测灵敏度
当用CRISPClean去除样品时，检测到更多的细菌种类。
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